而被视为西夷精锐的西夷3军团，在军事改革后重新编制为帝国的海军陆战军团，属于独立于海军和陆军之外的军队编制，受帝国领导，也就是孙林单独指挥，被西夷人誉为天皇卫队。
进过这样的整编，日不落帝国的海军在建制上也做出了重新的规划，值得一提的是这一次规划直到未来几十年都未曾改变过：主体之上，日不落帝国如今海军共分成了三大编制与一个游离在外的海军编制。
第一类就是由西夷舰队撤番之后预留下来的官宅船与千火船组成的帝国河流舰队，当然说是舰队事实上河流舰队根本不能说是舰队，只不过是一些沿河沿江的城市中，民兵部队所使用的船只罢了，而且事实上很多沿河沿江城市根本就没有配备官宅船，有的只是千火船这种搭载人数不过30人的机动小船罢了。
不过这对于本身并不是很宽阔的河流、江面来说足够了，而且千火船作为巨型战舰杀手，事实上这些小船的威力绝对不容小视，而他们自带的希腊火喷射装置足已满足帝国各个河流江水的巡逻任务，而强大的机动能够足够在短时间内将危险情报传达出去。
第二类则师高于河流舰队的沿海舰队，比起河流舰队，沿海舰队的巡逻范围不仅广泛，而且在数量上甚至达到了日不落第三类：日不落海军舰队的三倍之多，当然这里所比较的是人数和战舰数量，如果比较实力的话那沿海舰队可就不咋地了。
沿海舰队主要是清除海域内的海盗并巡逻帝国海疆，所以沿海舰队在战舰选择上与河流舰队一样，都是选择速度较快的战舰，不过因为巡逻的区域与作战的对象不同，所以沿海舰队基本都配备了拥有12门火炮的霍克突击舰，与少量配备了28门的加列战舰。
火炮是正规军淘汰下来的一号火炮，而战舰基本上也是马奇诺会战期间受到重创但还可以修复、拉回造船厂翻新后的战舰，而人员也是由陆军地方部队级带领训练出来的菜鸟兵，本身战斗力其实并不是很强，不过用于执行巡逻沿海地区、打击海盗等任务还是足以胜任的，而且孙林答应海军方面会先为期更换热武器装备，这里的更换对象可是包括沿海舰队的。
而位于最高位，也就是之前所提到的日不落海军舰队，则是如今帝国真正的海军，新扩建的海军将拥有当初日不落第一海军舰队三倍的数量，因为孙林的意思是帝国需要组建三个海军舰队，其中两个放在外海，一个放在内海。
各舰队的编制包括70艘霍克突击舰、150艘加列战舰、35艘霍克加铁甲战舰与8艘巨鲸级霍克加战舰，与200艘以上铁甲运输舰。同时还附带有4支娜迦军团与一支鱼人侦查军团，和两支西夷海军陆战军团。，这样一算的话，事实上三个日不落舰队的每支舰队作战人口已经达到了10万，而总人口包括后勤人口的话甚至能够达到12、13万，这也就只有日不落这种极度重视海军的国家才会这么做。
不过别看三支舰队加起来的人口超过了30万，不过这其中有一半并不是帝国人类的人口，而余下的又有6万万西夷士兵来自于当初的西夷舰队和军团，再加上最后剩下的人口中也有很多是来自于当初日不落第一舰队，本质上这次海军虽然也在军改之后进行了一次扩招，但扩招人数只有几万而已。
而最后那个游离在海军之外的舰队，事实上就是所谓的日不落皇家舰队，因为其特殊性，这个舰队的信息至今只有孙林和皇家舰队高层几个人知道，无论是在战舰质量上还是远程武器、作战水手方面，都是个迷，人们唯一知道，只不过是这个舰队拥有一艘超巨型战舰：皇家胜利号，与一艘已经沦为帝国皇族海上行宫的日本丸。
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