照此办法围困下去的话，京都必然沦陷，可这时候严广儒也收到了消息，神户已经被日寇主力包围，第三军陷入了苦战之中。而陈懋也送来了新的命令，要第六军不惜一切代价，以最快的速度打下京都。被这一逼，严广儒想到里一个好办法。
当日晚，严广儒故意让城南的防线出现了松动，将几个日寇的信使放了出去，接着，用骑兵在外围将这几个日寇的信使都拦截了下来（结果，还是放跑了几人）。严广儒在审问了这伙日寇的信使之后，给了他们一次机会，让他们跟明军合作。当然，不怕死的人肯定有，那怕死的人也肯定有。结果，两个日寇信使屈服了。
严广儒让这两人吃了点皮肉之苦后，吩咐了一番，过了两日，就将他们放了回去。而这两个日寇将给京都的日寇守军带去一条具有“决定”性意义的消息——织田信长的主力在神户被明军全歼了！
当然，这消息是严广儒炮制出来的。在放走了这两个日寇之后，严广儒也下令步兵做好了攻城的准备。他也想好了，这一招管用最好，到时候日寇主动投降，省了不少的麻烦。如果不管用，那就强攻，就算付出点代价，也必须要在今日之内打下京都！
这一招确实收到了效果。当京都的日寇守将听闻织田信长大军被全歼，连织田信长都失踪的消息之后，心里大骇不已。接着，明军大军压城，攻城站迫在眉睫。在他看来，明军等的也正是这一消息，织田信长的主力被歼灭之后，明军已无后顾之忧，所以可以集中兵力攻城。
日寇守将三思之后，终于做出了一个将影响后世数百年的决定：投降！在日本历史上，这个不知名的日寇将领（明史，日本史中都无记载，只是含糊的说了一句是个普通的军官而已，还不是将军）的决定引起了很大的争论。有人认为，他如果再坚持守上几日，把消息送给织田信长的话，那么神户一战的结果就将完全不一样，到时候明军的计划就将完全失败。同样的，也有人认为，他投降与否其实并没有太大的关系，以当时明军队实力来讲，打下京都是不成任何问题的。当然，也正是这名日寇的将领选择了投降，这才没有让京都在战火中化为一片废墟（不过后来还是避免不了的被明军炸成了废墟），保持了日本的首都，不然的话，这座有着上千年历史的城市就将彻底的从地球上消失了！
日寇主动投降，严广儒松了口气，立即派兵入城，收缴了日寇武装。而此时，朱祁钰严禁滥杀无辜的命令也早就传了过来，严广儒自然不敢乱杀一人，将日寇，以及城内的日本人都集中看管了起来。而在此之前，他已经派人以最快的速度去通知陈懋，邓茂，以及卫平，报告占领京都的消息。
只不过，此时神户已经被彻底围困，严广儒派出的军官没有能够直接进入神户，而是在海边绕了一圈，找到了李舜臣的舰队，这才让李舜臣把消息带给了卫平。也正是如此，明军占领京都的消息晚了几个时辰送到卫平这边来。当卫平接到消息的时候，织田信长也已经从那些偷偷逃出京都，不肯向明军投降的日寇那里得知了京都沦陷的消息。
织田信长此时是没有选择的。他一直认为明军的步兵军都集中在神户，现在他也认识到这个判断错了。明军还有一支强大的步兵军集中在了京都附近。现在京都已经沦陷，如果这支步兵军以最快的速度南下的话，他就将遭到夹击。无奈之下，织田信长只能撤出神户地区，返回大阪，并且一路退到了奈良城，准备在这里固守。另外，织田信长也没有忘记通知在福知山坚守的明智光秀，让他也撤退到敦贺一线，在若荚湾与琵琶湖之间组建新的防线。
可以说，陈懋这次组织的战役进攻打得非常漂亮。除了陈懋的部署得当之外，各部的奋力战斗也是关键中的关键。而这其中，第三军与第二军是功劳最大的两支部队。而对卫平来说，正因为第三军在神户一战中表现非常突出，不但攻破了神户，而且还在城外挡住了日寇十多万大军的围攻，才导致织田信长误认为明军的重点是在福知山-神户防线，而忽略了京都方向上的防御，为第六军创造了机会。
同样的，第二军的顽强阻击，为第三军攻克神户创造了机会，如无第二军的顽强阻击，两万多将士用生命换来的战果，那么第三军不但无法攻克神户，还将遭到日寇的前后夹击，必然遭受彻底的失败。
相对而言，第一军在北面缠住了福知山的四万多日寇，第六军攻占京都，虽然也都意义重大，为完成进攻战役做出了巨大的贡献，不过，其在战场上的表现也绝对没有第三军与第二军这么抢眼了！
明军取得胜利的另外一大关键就是陈懋对战局的准确判断，对己方军队的了解，以及做出的完整的战役部署。当陈懋决定让第三军在神户独挑大梁的时候，卫平都有点担心第三军能否稳住阵脚，不过，他最后做到了，而且从始至终，陈懋都没有向卫平增添一兵一足，即使是在神户战斗最危急的时刻，陈懋也就最多让李舜臣的舰队去支援卫平，而没有把第六军派往神户战场。光是这点胆识，以及魄力，恐怕就不是多少将军能够具备的了。
另外，陈懋对第二军的重用，也在战役中起到了极为重要的作用。陈豫在得到了重用之后，并没有辜负这个老上级的期望，虽然第二军损失大半人马，但是最后仍然完成了战役任务，成功的拖延了日寇主力的进军步伐！
如果说，第三军在神户的进攻是一击钩拳，命中了日寇的软肋的话，那么第六军在京都的进攻则是一击又重又沉的直拳，直接打在了日寇的要害之上，就连朱祁钰在听闻第六军顺利占领了京都之后，都兴奋得跳了起来。而明军这一路打出的组合拳，让日寇应接不暇，即使是织田信长都没能准确的判断出明军重拳的方向，更无从谈起进行防御了！
这一战，明军的损失也不小，是在整个东征战争中，仅次于马关防御战与今市城攻防战之后的，损失第三大的战役。参战的四个军，一共损失人马四万余人，其中第二军的损失最为惨重，全军减员大半，而第三军的损失也不小，伤亡官兵近两万人。经过这一战之后，西路大军的能力也发挥到了极限，再也无力在短时间之内组织大规模的进攻了，只能在奈良到敦贺一线与日寇对峙。甚至可以说，这是西路大军在此次战争中的最后一次大规模进攻战役！
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