漳州一战，新华军歼灭清军达到两万余人，除去那些溃逃的人，逃回厦门岛上的清军，只有三万余人而已。只有最初的一半了。这让福建陆路提督普陀保非常的沮丧，一面加紧部署厦门岛上的防御，另外一面则向福州的闽浙总督怡良和福州将军璧昌求援。福建的军队，除了三万绿营之外，还有上万的八旗兵。只不过，这些八旗兵有多大的战斗力，这就很难说了。
3月1日下午，新华军抵达了下面，隔着海峡同厦门岛相望。虽然，新华军兵临厦门，让普陀保和李廷钰两人有些担心，但是有海峡相隔，他们心里还是很镇定的。
“哼！以为这只有一公里多宽的海峡就能够阻挡他们吗？简直就是妄想。海军的两艘巡洋舰到哪里了？什么时候才能够来？”周老四准将不屑的说道。
“老周，海军的两艘巡洋舰昨天下午才从汕头出发，预计今天就能够抵达。”第13旅旅长古赟准将说道。厦门岛的海峡，并不宽，只有一公里多一点而已。新华军陆军装备的野战炮，完全能够对海峡对岸进行炮击，然后掩护步兵登陆。不过，一时半会儿找不到那么多的船只。跟随海军的巡洋舰一同抵达的，还有十来艘运输船和商船。到时候，新华军就可以利用这些运输船和商船渡过海峡，攻击岛上的清军。
当天傍晚，新华军海军的第42号巡洋舰和第44号巡洋舰抵达厦门，在这两艘巡洋舰的身后，则是11艘运输船和商船。两艘巡洋舰抵达之后，立刻对福建水师残余的战船发起了攻击。福建水师的主要实力之前就已经被新华国海军第1舰队给消灭了，面对新华国海军的两艘巡洋舰，更是没有反击之力。
当舰炮在海面上回响，伴随着清军的战船一艘接着一艘的被击沉。等到日落的时候，清军福建水师的战船已经被全部干掉了。
3月2日早上，新华军5个炮兵营开始对海峡对岸的清军阵地开火。一公里多一点的海峡，根本就抵挡不了新华军的炮火。两艘巡洋舰也用战舰上的舰炮轰击清军的阵地。战舰上的105毫米舰炮和75毫米舰炮，威力可比陆军使用的75毫米野战炮大得多了。猛烈的炮击，让退守厦门岛的清军损失惨重。不得不放弃滩头阵地，向厦门岛中心撤退。
早上九点，新华军陆军第3旅的两个步兵营，搭乘运输船和商船，渡过海峡，在厦门岛登陆。在海军的两艘巡洋舰的炮火的掩护下，向岛屿中心进攻。其他的部队，也开始陆续的运往厦门岛。
随着登陆厦门岛的新华军越来越多，清军付出的伤亡也越来越大，抵抗也变得越来越微弱。
当天下午4点，新华军的一枚炮弹击中了清军的指挥部，福建陆路提督普陀保被当场炸死，浙江提督李廷钰运气较好，一点伤都没有。但是，他已经被吓破胆了。他知道，如果继续打下去的话，他肯定会步上普陀保的后尘的。因此，李廷钰第一时间派人向新华军乞降。
新华军陆军第3旅旅长周老四准将，接受了浙江提督李廷钰的投降，至此，清军福建方向的主力被消灭。
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