而在管制的过程中，清军和一批与清军勾结的当地豪族则趁机巧立名目，强占田地财产，从中聚敛无厌，山东的百姓在清廷的统治下，本来就十分不满，而现在又进行压制，因此在顺治六年（1649年）二月，高苑人谢迁汇聚乡亲赵束乡、丁可泽等人，率千余人在山东高苑一带发起反清起义。
这时清廷在山东约有十万左右的兵力，人马到是不少，但阿巴泰深知中华军最善于在局部集中兵力，逐个击破，因此也不敢轻易分散兵力，将主要的兵力都集中，沿大清河北岸，驻守在济南到兖州一线，在济南府的中东部地区虽然青州府交界，但山地众多，并不是防守的要点，因此驻守的兵力并不多，这也给了起义军以可趁之机。
而且由于山东百姓对清廷的不满情绪己经发展了极限，因此也都纷纷投靠谢迁，因此起义军的势力发展很快，到三月份时，就扩大到了一万余人，转战济南府东中部地区，相继攻克了高苑、新城、长山、淄川等地，杀死了清廷的高苑知县武振华，长山知县周懋臣等人。
在顺治六年三月，起义军攻克淄川城之后，抓获了在城里居住的，被革职居家的乡绅孙之獬。
在三年以前，孙之獬曾向清廷上言，建议清廷治下的所有汉族百姓皆从满俗，易服剃发，从而也引发了清廷下达剃发令，而孙之獬也因此得到了清廷的赏识，一度官运亨通，出任都察院右副都御史兼兵部尚书，招抚江西提督军务。但商毅收复南京之后，清廷在江南的官员纷纷北逃，孙之獬到也机灵，当然也在其列。但逃回了北京之后，清廷的汉官也都恨其无耻，因此借机纷纷弹亥孙之獬弃职之罪，结果清廷将孙之獬革职，只好回到老家安居。
在起义军围攻淄川县的时候，淄川知县刘修己认为孙之獬做过兵部尚书，又招抚过江西，有军事才能，又经过实战锻炼，于是邀请孙之獬帮助自己守城。
而被清廷罢职之后，孙之獬一直都不甘心，盼着能够有机会再被清廷启用，而在他看来，农民起义军不过是一批乌合之众，而且淄川离济南不足三百里，最多五六日，淸廷的援军就可以赶到，因此正是一个向清廷表示自己忠心的大好机会。于是不仅应刘修己所请，招集家人，帮助清军守城，而且还倾尽家财，设立重奖守城的清兵，满以为可以守住淄川，等着援军来到。
那知在谢迁率领起义军进攻到淄川县城的时候，城里的百姓自发组织暴乱，打开城门，放起义军入城，孙之獬听到城破之后，退入自己的住宅。穿上官服，向北遥拜后，欲悬梁自尽。但这时，义军己蜂拥而至，闯入内宅，将孙之獬救下，捆绑起来，押解到县衙。
虽然说清廷下达剃发令，实际是势在必，孙之獬的上言，不过只是一个导火索，但当上了出头鸟，自然也就成为了众矢之的。因此抓住了孙之獬，当然不会放过。于是就在县衙，甴谢迁当众宣布其罪状，用锥子遍刺其身，插上头发，恨声不绝地骂道：“我为汝种发！”
孙之獬自知自己众怒难犯，已无活理，于是破口大骂，只求速死。被他激动的起义军将其口缝上，凌迟而死，还把他在城中的孙子、曾孙杀了个干净。孙之獬一家八口人，全部死在淄川城中。
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